تفاوت های اساسی بین سی تی اسکن مولتی اسلایس ( MSCT) با CBCT شامل موارد زیر می باشد:

1 دوز اشعه : CBCT بسیار کمتر از MSCT  می باشد

2کیفیت تصویر: برای بافت های سختی مثل دندان، CBCT قدرت تفکیک بهتر، رزولوشن و وضوح بالاتری نسبت به MSCT ایجاد می کند.

3 کاهش آرتیفکت فلزات: این مساله بسیار مهمی است چون اکثر بیماران دارای دندان پرشده با فلز هستند و در سی تی اسکن معمولی باعث ایجاد آرتیفکت های شدید در اطراف ناحیه مورد نظر می شود.